在进行硬盘格式化之前，确保您已经备份了所有重要数据，因为格式化将会清除硬盘上的所有数据。PE系统（Preinstallation Environment）是一种基于Windows的启动环境，常用于系统安装或故障修复。以下是如何在PE系统中整个硬盘进行格式化的步骤：
1. 启动电脑，进入PE系统。您可以通过将PE系统光盘或U盘插入电脑，然后从光盘或U盘启动电脑来实现。
2. 进入PE系统后，找到并打开“磁盘管理”工具。在PE系统中，通常可以在“开始”菜单或“系统工具”中找到它。
3. 在磁盘管理窗口中，您将看到电脑上所有硬盘的列表。找到您想要格式化的硬盘，右键点击它，然后选择“格式化”。
4. 在格式化窗口中，您需要选择文件系统类型。常用的文件系统类型有NTFS和FAT32。NTFS是Windows推荐的文件系统，支持更大的文件和更好的数据保护。FAT32适用于较旧的系统或存储设备。根据您的需求选择合适的文件系统类型。
5. 设置卷标。卷标是硬盘的名称，您可以为硬盘设置一个易于识别的名称，以便在Windows系统中快速找到它。
6. 选择分配单元大小。分配单元大小是指文件系统为每个文件分配的最小空间。通常，默认值即可。
7. 点击“开始”按钮，开始格式化硬盘。这个过程可能需要一段时间，请耐心等待。
8. 格式化完成后，您可以在磁盘管理窗口中看到新格式化的硬盘。现在，您可以在这个硬盘上安装操作系统或存储数据了。
需要注意的是，格式化硬盘将会清除硬盘上的所有数据，因此务必在格式化前备份重要数据。在格式化过程中，如果遇到任何问题，可以尝试重新启动PE系统，然后再次尝试格式化。如果问题仍然存在，可能需要考虑其他故障修复方法。